home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ BCI NET 2 / BCI NET 2.iso / archives / demos / misc / prosite.lha / Prosite / data / PDOC00389 < prev    next >
Encoding:
Text File  |  1995-03-04  |  1.9 KB  |  36 lines
  1. ***********************************************************
  2. * Isocitrate and isopropylmalate dehydrogenases signature *
  3. ***********************************************************
  4.  
  5. Isocitrate dehydrogenase  (IDH) [1,2] is an  important  enzyme of carbohydrate
  6. metabolism which catalyzes  the  oxidative  decarboxylation of isocitrate into
  7. alpha-ketoglutarate. IDH is either dependent on NAD+ (EC 1.1.1.41) or on NADP+
  8. (EC 1.1.1.42). In eukaryotes there are at least three isozymes of IDH: two are
  9. located in  the  mitochondrial matrix  (one NAD+-dependent,  the  other NADP+-
  10. dependent), while the  third  one  (also NADP+-dependent) is  cytoplasmic.  In
  11. Escherichia coli the  activity  of  a  NADP+-dependent form  of  the enzyme is
  12. controlled by the phosphorylation of a serine residue; the phosphorylated form
  13. of IDH is completely inactivated.
  14.  
  15. 3-isopropylmalate dehydrogenase (EC 1.1.1.85) (IMDH) [3]  catalyzes  the third
  16. step in the  biosynthesis of leucine in  bacteria  and   fungi, the  oxidative
  17. decarboxylation of 3-isopropylmalate into 2-oxo-4-methylvalerate.
  18.  
  19. IDH and IMDH  are evolutionary related [1,3].  The  best  conserved  region of
  20. these enzymes is  a glycine-rich stretch of residues located in the C-terminal
  21. section. We have used this region as a signature pattern.
  22.  
  23. -Consensus pattern: N-[LIMVFY]-x-G-D-[LIMVFY]-x-[SG]-[DN]-x(2)-[SA]-x(3,4)-G-
  24.                     [SG]-[LIVM]-G-[LIVMF]
  25. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  26. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  27. -Last update: October 1993 / Pattern and text revised.
  28.  
  29. [ 1] Hurley J.H., Thorsness P.E., Ramalingam V., Helmers N.H.,
  30.      Koshland D.E. Jr., Stroud R.M.
  31.      Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 86:8635-8639(1989).
  32. [ 2] Cupp J.R., McAlister-Henn L.
  33.      J. Biol. Chem. 266:22199-22205(1991).
  34. [ 3] Imada K., Sato M., Tanaka N., Katsube Y., Matsuura Y., Oshima T.
  35.      J. Mol. Biol. 222:725-738(1991).
  36.